Тут можно сформулировать туманный но провокационный вопрос: Параметры, наблюдаемые при работе программы чем-то хуже параметров, наблюдаемых в физическом мире?
Ответа два:
- да, хуже т.к. физические параметры ближе к мировому алгоритму а программные дальше (в большей степени находятся в феноменологии).
- нет, ничем не хуже т.к. оба вида параметров - это кусок феноменологии, образовавшаяся поверх единого целого "субъект-объект", которое сумело кристаллизоваться в нечто конкретное(попасть в плен конкретного?).

Второй ответ предполагает нечто типа "слабой редукции" в строении бытия в противовес обычной сильной редукции, на которую полагается наука.
То что происходит на высших уровнях происходит потому, что происходит независимо от базового уровня. Задача базового слоя - представить редукционное объяснение (любое) происходящего наверху. С другой стороны, на высших уровнях не может происходить ничего, что не могло бы быть объяснено редукционно. Когда разрыв между верхом и низом достаточно велик, редукция может быть индифферентной к феноменологии высшего уровня, объясняя с одинаковым успехом любую точку в фазовом пространстве возможных высших феноменологий. Таким образом, базовый алгоритм если он и существует совсем не является базовым (только объяснительным), а парадокс марионетки является следствием существующей на данный момент неразвитости феноменологии высшего уровня. И так далее по кругу...